Nezaplacené faktury začínají firmy bolet. Musí vracet DPH

Na firmy postupně dopadá nová DPH povinnost. Kdo nezaplatil faktury, musí vracet odpočet. Podle odborníků to bude znamenat zásah do cash-flow tisíců firem. Varují přitom, že podcenění evidence závazků může vést k problémům s finančním úřadem.
Podle nového pravidla musí plátce DPH upravit odpočet, pokud fakturu neuhradí do šesti měsíců od konce měsíce, v němž byla splatná. Například faktura s datem zdanitelného plnění 31. ledna a splatností 31. března má rozhodný den 30. září. Pokud do té doby nedojde k platbě, je třeba upravit odpočet v přiznání za září – tedy do 25. října.
„Teď se ukazuje, že tato změna není jen teoretická,“ komentuje Ivana Brancuzká, CEO a partnerka poradenské firmy Crowe. „Společnosti, které nezaplatily faktury z počátku roku, už musejí DPH vracet. V praxi to znamená reálný dopad do jejich cash-flow,“ upozorňuje s tím, že řada podniků to možná zjistí až nyní, při přípravě přiznání.
Koho se to týká
Povinnost se vztahuje na transakce uskutečněné po 1. lednu 2025. Starší závazky jako faktury z roku 2024 a dříve zůstávají bez vlivu.
Nová úprava dopadá na všechny plátce DPH, kteří si uplatnili odpočet z přijatého zdanitelného plnění bez ohledu na to, zda jde o zboží nebo služby. Výjimku mají pouze plnění v režimu přenesené daňové povinnosti, kdy si příjemce daň přiznává sám.
Typicky jde o stavební firmy, které si daň odvádějí sami a neuplatňují odpočet na základě dokladu od dodavatele. Na ně se nová povinnost nevztahuje.
Co dělat, když firma zaplatí později
Pokud firma platbu provede po úpravě odpočtu, může si odpovídající část DPH znovu nárokovat, ovšem až ve zdaňovacím období, kdy k úhradě došlo. Musí přitom dodržet lhůtu pro uplatnění odpočtu, která činí dva roky od konce kalendářního roku, v němž mohla být úprava poprvé provedena.
„Z pohledu finanční správy jde o logický krok, kdy stát nechce vracet DPH z faktur, které nebyly nikdy zaplacené,“ uvádí Ivana Brancuzká. „Pro podniky je to ale další administrativní zátěž, která vyžaduje přísnou disciplínu a přesnou evidenci závazků.“
Pozor na záludnosti
Důležitá je i správná evidence částečných plateb, zádržného nebo započtení pohledávek – všechny tyto situace mají na úpravu odpočtu vliv.
Praxe přináší řadu komplikací, jako například částečné úhrady. Zaplatíte-li jen polovinu faktury, musíte opravit odpočet pouze z neuhrazené části. Stejně fungují i zápočty. Pokud jste s dodavatelem vzájemně vyrovnali pohledávky, považuje se to za úhradu.
Stavební firmy často zadržují část platby, třeba deset procent na delší dobu. V takovém případě má každá část vlastní datum splatnosti a účetní ji musí sledovat samostatně,“ radí Ivana Brancuzká z Crowe.
Podle ní by si firmy měly nastavit interní kontrolní procesy, které automaticky sledují dobu po splatnosti a upozorní na blížící se šestiměsíční lhůtu.
„Doporučuji udělat systematickou kontrolu všech závazků podle splatnosti, jinak hrozí sankce,“ upozorňuje Ivana Brancuzká a dodává: „První vlnu úprav DPH za nezaplacené faktury teď řeší odhadem tisíce podniků.“ (20.10.2025)