Ministerstvo životního prostředí potvrdilo závažné nedostatky v hospodaření Správy Krkonošského národního parku (KRNAP), které se týkají uplatňování odpočtů DPH a nastavení vnitřních kontrolních mechanismů. Finanční úřad doměřil Správě KRNAP za roky 2021 a 2022 DPH ve výši 20,7 milionu korun, s pokutou jde patrně o téměř 25 milionů korun. Zjištěné nedostatky potvrdila také nezávislá společnost. Obdobná pochybení se potvrdila také v dalších letech, celkové finanční dopady dosáhnou až 100 milionů korun. Jedná se o předběžný odhad, který bude možné upřesnit po prověření dalších období.
Po zjištění pochybení při kontrole finančního úřadu ministr životního prostředí Igor Červený nařídil ve Správě KRNAP veřejnosprávní kontrolu. Její protokol byl dokončen 30. října 2026. Kontrola prověřila okolnosti vzniku nedostatků, nastavení účetních a kontrolních procesů i možné finanční dopady. Na základě těchto zjištění ministerstvo prověřuje také hospodaření dalších národních parků.
„Závažné je nejen to, že kvůli nesprávně nastaveným postupům musí Správa KRNAP doplácet miliony korun, ale také otázka, proč se problém neřešil už dříve. Podle dosavadních zjištění existovaly informace o nesprávném postupu již za předchozího vedení. Tehdejší ministr Hladík a část vedení resortu MŽP o problému vědělo, dle Vyjádření ke kontrolám FÚ Trutnov v dopise od Správy KRNAP, Naše značka: KRNAP 06808/2026, a nezajistili nápravu. Musíme zjistit proč a kdo za to nesl odpovědnost. Veřejné prostředky musí být spravovány odpovědně a v souladu se zákonem. Chci, abychom znali celý rozsah finančních dopadů a přijali opatření, která zabrání opakování podobných případů,“ uvádí ministr životního prostředí Igor Červený.
Nesprávně uplatněné odpočty DPH
Kontrola finančního úřadu se zaměřila na zúčtování DPH Správou KRNAP v letech 2021 a 2022. Finanční úřad na problém upozornil v roce 2024 a následně zahájil kontrolu. Zjištěné nedostatky potvrdil také nezávislý daňový poradce.
Podstatou problému bylo uplatňování odpočtů DPH v rozsahu, který podle závěrů daňové kontroly neodpovídal příslušným právním pravidlům a judikatuře Soudního dvora Evropské unie. Správa KRNAP používala jednotný poměr pro výpočet odpočtu daně odvozený od výnosů. Odpočet uplatňovala také u některých plnění souvisejících výhradně s ochranou přírody, u nichž podle daňového posouzení nárok na odpočet nevznikal.
Za kontrolované období finanční úřad doměřil DPH ve výši 20,7 milionu korun. K tomu se připočítává penále, jehož přesnou aktuální výši je třeba potvrdit. Správa KRNAP se proti doměření daně odvolala a čeká na rozhodnutí odvolacího orgánu finanční správy.
„Kontrola se nezaměřila pouze na samotnou výši uplatněných odpočtů DPH, ale také na postupy, podle kterých Správa KRNAP při jejich výpočtu postupovala. Prověřovali jsme nastavení účetních procesů, oddělování hlavní a hospodářské činnosti i fungování vnitřních kontrolních mechanismů. Nyní je důležité vyhodnotit všechny souvislosti, a na jejich základě doložených skutečností stanovit potřebná nápravná opatření, včetně podání dodatečných daňových přiznání,“ říká Stanislav Masák, ředitel odboru interního auditu a kontroly Ministerstva životního prostředí.
Finanční dopady mohou dosáhnout až 100 milionů korun
Doměřením DPH za roky 2021 a 2022 finanční dopady nekončí, protože nesprávně nastavený systém uplatňování odpočtů DPH byl používán i v dalších letech, tedy až do roku 2026. Celkové finanční dopady pravděpodobně dosáhnou až 100 milionů korun.
„V souvislosti se vznikem a dlouhodobým neřešením tohoto problému považuji za nezbytné prověřit odpovědnost bývalého vedení správy parku, případně externího daňového poradce.
Připravuji proto také personální kroky, jejichž cílem bude stabilizace ekonomické řízení organizace a nápravu zjištěných nedostatků. Navzdory špatnému hospodaření byly za působení bývalého ředitele některým náměstkům a vedoucím pracovníkům vypláceny statisícové odměny. Jen v loňském roce Správa KRNAP vyplatila na odměnách téměř 13 milionů korun,“ uvádí Petr Moravec, ředitel Správy KRNAP.
Nedostatky v účetnictví a vnitřním kontrolním systému
Kontrolní zjištění se týkají účetních postupů a vnitřních kontrol. Prověřovány byly zejména způsoby účtování výnosů z hospodářské a hlavní činnosti, a jejich vykazování. Zjištěny byly nedostatky v účetnictví, v kontrole přijatých dokladů a ve fungování vnitřního kontrolního systému.
Pracovníci finančního úřadu v rámci daňového řízení a následně v obecné rovině zástupci Generálního finančního ředitelství na opakovaných jednáních vysvětlili zástupcům KRNAP princip zmíněných ustanovení § 72 a § 75 zákona o DPH, obsahujících koncepci a mechanismy uplatnění nároku na odpočet DPH a jeho krácení, včetně jejich aplikace v jednotlivých konkrétních případech. MŽP tedy využije všechny řádné a mimořádné prostředky.
MŽP prověřuje hospodaření všech národních parků
Na základě zjištění v KRNAP ministerstvo prověřuje také ekonomické a kontrolní procesy v dalších národních parcích. Cílem je ověřit, zda postupy odpovídají právním předpisům a správně oddělují jednotlivé druhy činností, a jestli jejich vnitřní kontrolní mechanismy fungují dostatečně.
Návrh opatření vůči správám národních parků
Na základě provedené veřejnosprávní kontroly se stanovují opatření, jako prověření zřizovacích listin všech správ národních parků, jejich sjednocení a doplnění, zpracována bude metodika pro ekonomické a odborné řízení správ národních parků v oblasti vedení účetnictví. Bude zaveden také nový kontrolní modul v rámci informačního systému národních parků. (3.11.2026)
